MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 22398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021880	TAG	2	6	217197	217202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463541
3502	NC_021880	TAT	2	6	217260	217265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463541
3503	NC_021880	CT	3	6	217319	217324	0 %	50 %	0 %	50 %	526463541
3504	NC_021880	CA	3	6	217365	217370	50 %	0 %	0 %	50 %	526463541
3505	NC_021880	CGA	2	6	217387	217392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463541
3506	NC_021880	CGC	2	6	217393	217398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526463541
3507	NC_021880	AGA	2	6	217503	217508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462969
3508	NC_021880	GCG	2	6	217600	217605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526462969
3509	NC_021880	TA	4	8	217694	217701	50 %	50 %	0 %	0 %	526462969
3510	NC_021880	GA	3	6	217705	217710	50 %	0 %	50 %	0 %	526462969
3511	NC_021880	AAG	2	6	217816	217821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462969
3512	NC_021880	CAG	2	6	217883	217888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462969
3513	NC_021880	TAG	2	6	217967	217972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462969
3514	NC_021880	GTA	2	6	217975	217980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462969
3515	NC_021880	AG	3	6	217985	217990	50 %	0 %	50 %	0 %	526462969
3516	NC_021880	CTTT	2	8	217999	218006	0 %	75 %	0 %	25 %	526462969
3517	NC_021880	GAC	2	6	218050	218055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462969
3518	NC_021880	TC	3	6	218077	218082	0 %	50 %	0 %	50 %	526462969
3519	NC_021880	GGC	2	6	218116	218121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526462969
3520	NC_021880	AGG	2	6	218163	218168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462969
3521	NC_021880	GGCA	2	8	218217	218224	25 %	0 %	50 %	25 %	526462969
3522	NC_021880	TTA	2	6	218393	218398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462969
3523	NC_021880	TTC	2	6	219228	219233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462970
3524	NC_021880	TGC	2	6	219235	219240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462970
3525	NC_021880	TTC	2	6	219340	219345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462970
3526	NC_021880	CCT	2	6	219369	219374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462970
3527	NC_021880	TTTTC	2	10	219513	219522	0 %	80 %	0 %	20 %	526462970
3528	NC_021880	GCAATG	2	12	219533	219544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526462970
3529	NC_021880	GCAT	2	8	219602	219609	25 %	25 %	25 %	25 %	526462970
3530	NC_021880	T	8	8	219616	219623	0 %	100 %	0 %	0 %	526462970
3531	NC_021880	ATC	2	6	219778	219783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462970
3532	NC_021880	ATC	2	6	219785	219790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462970
3533	NC_021880	TATG	2	8	219796	219803	25 %	50 %	25 %	0 %	526462970
3534	NC_021880	AAAG	2	8	219845	219852	75 %	0 %	25 %	0 %	526462970
3535	NC_021880	CTT	2	6	219891	219896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462970
3536	NC_021880	AGA	2	6	219930	219935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462970
3537	NC_021880	T	7	7	219945	219951	0 %	100 %	0 %	0 %	526462970
3538	NC_021880	CTC	2	6	220049	220054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462970
3539	NC_021880	AAG	2	6	220083	220088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462970
3540	NC_021880	AGTT	2	8	220113	220120	25 %	50 %	25 %	0 %	526462970
3541	NC_021880	TCT	2	6	220184	220189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462970
3542	NC_021880	AG	3	6	220224	220229	50 %	0 %	50 %	0 %	526462970
3543	NC_021880	T	6	6	220281	220286	0 %	100 %	0 %	0 %	526462970
3544	NC_021880	GGA	2	6	220421	220426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462970
3545	NC_021880	CCTG	2	8	220507	220514	0 %	25 %	25 %	50 %	526462970
3546	NC_021880	AAG	2	6	220553	220558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462970
3547	NC_021880	GAG	2	6	220619	220624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462970
3548	NC_021880	TTC	2	6	220636	220641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462970
3549	NC_021880	ACT	2	6	220664	220669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462970
3550	NC_021880	TAG	2	6	220719	220724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462970
3551	NC_021880	ACT	3	9	220862	220870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462970
3552	NC_021880	ACC	2	6	220882	220887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526462970
3553	NC_021880	TC	3	6	220908	220913	0 %	50 %	0 %	50 %	526462970
3554	NC_021880	GCA	2	6	220964	220969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462970
3555	NC_021880	TCC	2	6	220996	221001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462970
3556	NC_021880	CAA	2	6	221004	221009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462970
3557	NC_021880	CTA	2	6	221010	221015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462970
3558	NC_021880	CAT	2	6	221016	221021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462970
3559	NC_021880	ATG	2	6	221097	221102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462971
3560	NC_021880	TTA	2	6	221118	221123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462971
3561	NC_021880	TAT	2	6	221146	221151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462971
3562	NC_021880	AGG	2	6	221197	221202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462971
3563	NC_021880	GGTA	2	8	221205	221212	25 %	25 %	50 %	0 %	526462971
3564	NC_021880	AGC	2	6	221272	221277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462971
3565	NC_021880	AGG	2	6	221306	221311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462971
3566	NC_021880	TGA	2	6	221324	221329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462971
3567	NC_021880	ATGCGT	2	12	221344	221355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526462971
3568	NC_021880	TAC	2	6	221443	221448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462971
3569	NC_021880	TGT	2	6	221455	221460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462971
3570	NC_021880	AAC	2	6	221532	221537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462971
3571	NC_021880	GCT	2	6	221604	221609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462971
3572	NC_021880	GCGTT	2	10	221649	221658	0 %	40 %	40 %	20 %	526462971
3573	NC_021880	TGC	2	6	221729	221734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462971
3574	NC_021880	TGA	3	9	221761	221769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462971
3575	NC_021880	TG	3	6	221976	221981	0 %	50 %	50 %	0 %	526463542
3576	NC_021880	AAGA	2	8	222030	222037	75 %	0 %	25 %	0 %	526463542
3577	NC_021880	AGC	2	6	222134	222139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463543
3578	NC_021880	GCAG	2	8	222146	222153	25 %	0 %	50 %	25 %	526463543
3579	NC_021880	ATC	2	6	222154	222159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463543
3580	NC_021880	CAA	2	6	222174	222179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463543
3581	NC_021880	AAGC	2	8	222250	222257	50 %	0 %	25 %	25 %	526463543
3582	NC_021880	CAT	2	6	223473	223478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463544
3583	NC_021880	ATG	2	6	223479	223484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463544
3584	NC_021880	TGA	2	6	223500	223505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463544
3585	NC_021880	AGA	2	6	223524	223529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463544
3586	NC_021880	CAA	2	6	223544	223549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463544
3587	NC_021880	CTA	2	6	223586	223591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463544
3588	NC_021880	T	6	6	223595	223600	0 %	100 %	0 %	0 %	526463544
3589	NC_021880	ATC	2	6	223656	223661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463544
3590	NC_021880	CGA	2	6	223683	223688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463544
3591	NC_021880	TAC	2	6	223703	223708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463544
3592	NC_021880	T	6	6	223721	223726	0 %	100 %	0 %	0 %	526463544
3593	NC_021880	GTT	2	6	223753	223758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463544
3594	NC_021880	ACC	2	6	223779	223784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463544
3595	NC_021880	CAC	2	6	223790	223795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463544
3596	NC_021880	AC	3	6	223862	223867	50 %	0 %	0 %	50 %	526463544
3597	NC_021880	CA	3	6	223902	223907	50 %	0 %	0 %	50 %	526463544
3598	NC_021880	T	6	6	224118	224123	0 %	100 %	0 %	0 %	526463545
3599	NC_021880	AAT	2	6	224124	224129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463545
3600	NC_021880	TTA	2	6	224150	224155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463545
3601	NC_021880	CAT	2	6	224307	224312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463545
3602	NC_021880	TAGAT	2	10	224325	224334	40 %	40 %	20 %	0 %	526463545
3603	NC_021880	CAG	2	6	224455	224460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463546
3604	NC_021880	AGA	2	6	224462	224467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463546
3605	NC_021880	CAA	2	6	224482	224487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463546
3606	NC_021880	T	6	6	224533	224538	0 %	100 %	0 %	0 %	526463546
3607	NC_021880	CTA	2	6	224554	224559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463546
3608	NC_021880	CTT	2	6	224663	224668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463546
3609	NC_021880	ACT	2	6	224675	224680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463546
3610	NC_021880	TG	5	10	224732	224741	0 %	50 %	50 %	0 %	526463547
3611	NC_021880	CCA	2	6	224763	224768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463547
3612	NC_021880	GCAGTT	2	12	224772	224783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526463547
3613	NC_021880	TAC	2	6	224800	224805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463547
3614	NC_021880	CTT	2	6	224810	224815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463547
3615	NC_021880	AAC	2	6	224918	224923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463547
3616	NC_021880	AAG	2	6	225309	225314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462972
3617	NC_021880	CAT	2	6	225346	225351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462972
3618	NC_021880	CAG	2	6	225412	225417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462972
3619	NC_021880	CAG	2	6	225442	225447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462972
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3621	NC_021880	ATT	2	6	225480	225485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462972
3622	NC_021880	CAT	2	6	225691	225696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462972
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3739	NC_021880	TATT	2	8	231975	231982	25 %	75 %	0 %	0 %	526462974
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3741	NC_021880	CTTC	2	8	232064	232071	0 %	50 %	0 %	50 %	526462974
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3985	NC_021880	TA	3	6	246432	246437	50 %	50 %	0 %	0 %	526462984
3986	NC_021880	TCC	2	6	246467	246472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462984
3987	NC_021880	CAGC	2	8	246501	246508	25 %	0 %	25 %	50 %	526462984
3988	NC_021880	TCT	2	6	246548	246553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462984
3989	NC_021880	ATG	2	6	246599	246604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462984
3990	NC_021880	TGT	2	6	246614	246619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462984
3991	NC_021880	TACT	2	8	246663	246670	25 %	50 %	0 %	25 %	526462984
3992	NC_021880	ATC	2	6	246692	246697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462984
3993	NC_021880	TA	3	6	246732	246737	50 %	50 %	0 %	0 %	526462984
3994	NC_021880	GT	3	6	247005	247010	0 %	50 %	50 %	0 %	526462984
3995	NC_021880	AAC	2	6	247108	247113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462984
3996	NC_021880	TCC	2	6	247159	247164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462984
3997	NC_021880	TC	3	6	247181	247186	0 %	50 %	0 %	50 %	526462984
3998	NC_021880	T	6	6	247212	247217	0 %	100 %	0 %	0 %	526462984
3999	NC_021880	TTC	2	6	247222	247227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462984
4000	NC_021880	CAC	2	6	247309	247314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526462984

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